一、机械裂解法主要有以下两中:
1.热休克(Thermal shock),既反复冻溶法,是一种常用的机械裂解方式比,通常由冷冻和解冻两部分组成(freezing and thawing),。原理:由于细胞内冰粒形成和剩余细胞液的盐浓度增高引起溶胀,使细胞结构破碎。冷冻通常在液氮或-20°C冰上进行,解冻可以在37、50、65 或100℃水浴中进热休克比化学裂解温和,但是很有效,有资料表明用热休克和溶菌酶与SDS的方法获得了90%的细胞裂解率。
2.超声波处理(Ultrasonication)既利用超声加热的方法,把细胞破碎。但这种处理会导致DNA 的断裂,所以加热不宜过剧烈,要设定好超声时间和间隙时间,一般超声时间不超过5秒,间隙时间最好大于超声时间,这些都有利于保护酶的活性。bead-beating 也是常用的机械处理方式,有报道指出bead-beating 比热休克和化学裂解的细胞裂解效果更好 虽然DNA产量较高,但通常得到的dna片段较小。
二、 化学裂解和酶裂解法(在提核酸时联合使用)
主要是裂解液处理法,细胞裂解液的主要目的有以下几种:(1)利用去污剂破坏脂质双分子层,破裂细胞;(2)溶解蛋白;(3)蛋白变性使其稳定;(4)抑制蛋白酶活性。
主要根据不同的目的,裂解液的组成有所不同,主要有提取核酸和蛋白两中。在提取RNA或DNA时,我们主要是要充分裂解细胞,得到更多的核酸;如果我们的目的是蛋白,那要根据蛋白的位置、特性等因素考虑裂解液,在提取蛋白后,再根据实验需要复性蛋白等。以下是细胞裂解中常用试剂和其作用:
50 mM Tris-HCl pH 7.4(缓冲体系),150 mM NaCl(等渗体系),1 mM PMSF (强大的蛋白酶抑制剂),1 mM EDTA(变性剂和稳定剂),5 µg/ml Aprotinin(蛋白酶抑制剂),5 µg/ml Leupeptin(蛋白酶抑制剂),1% Triton x-100(破坏细胞),1% Sodium deoxycholate(中度变性剂和蛋白溶解剂),0.1% SDS(强变性剂和蛋白溶解剂)。7M 尿素,2M硫脲(可以提高膜蛋白的融解),蛋白酶K等。
细胞裂解时间把握问题:孔板里细胞用PBS洗2次后,加入细胞裂解液,然后去测总蛋白含量和酶的活力,不知道细胞要裂解到什么程度?
答:因为所用的细胞类型不一样,所以实验的条件也需要摸索,建议这样来做:加入细胞裂解液后,不同时间取样,以时间和总蛋白含量和酶的活力作曲线,这样就可以找到裂解的最佳时间,仅供参考。
原核表达的细胞裂解问题:做原核表达,用BL21表达,之后如何裂解细胞才行呢?我的菌液只有300微升,说明书上用超声裂解细胞,但没给出具体做法,我们这只有大的探头,不好做,有什么好的办法么?
要是用超声裂解,要怎么做才行?我是超声15s间隔10s座4次。裂解不好,应该怎样改呀?!
答:请试一试IFCC推荐法:
1 收集细胞悬液
2 40C 低温离心(3000rpm,5min)
3 弃上清,加入一定量PBS(200ul),轻轻吹打混匀,-200C 冷冻30 min,
370C 解冻,如此反复3次,可形成细胞裂解液
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